Un bon usage des antibiotiques limite leur prescription aux cas d’infections bactériennes –et non virales. Dans le cas de maux de gorge, qui peuvent être d'origine bactérienne ou virale, les médecins de famille peuvent effectuer dans leur cabinet en quelques minutes un test très simple permettant d’identifier la présence d’un streptocoque (bactérie). Dans ce cas, la prescription d'un antibiotique est requise.
La médecine humaine n’est cependant pas la seule cause de surconsommation d’antibiotiques et de pression de sélection sur les bactéries. Trop d'antibiotiques sont utilisés dans les élevages d'animaux destinés à la consommation. Cette surconsommation entraîne automatiquement la résistance bactérienne et des risques sérieux pour la santé humaine.
Ainsi, dans le cas des bactéries Campilobacter, qui provoquent des gastro-entérites, c’est l’utilisation de fluoroquinolones dans les élevages de volailles qui a été pointé du doigt en Europe.
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